htaccess et sous-domaine

Bonjour, j'ai un site internet ( www.monsite.com par exemple) et un blog dessus www.monsite.com/blog
J'ai fait copié le blog, dans le dossiere blog, puis je suis allé dans le dossier blog/install du site dans un navigateur pour effectuer l'installation.
Récemment, j'ai créé un sous-domaine blog.monsite.com , mais problème: mon site se charge très mal à partir de cette adresse (en fait c'est un problème au niveau du css : le lien vers le fichier .css dans la page index.php est absolu: /blog/stylesheet.css ). En fait il est très simple de régler ce problème en mettant un lien relatif à la place, mais je me pose une question : comme c'est un blog ou je peux ajouter des applications etc… (dotclear), et que lors de l'installation, l'adresse du blog s'est enregistrée dans les fichiers de configuration en tant que www.monsite.com/blog , est-ce que ca ne risque pas de poser des problemes entre les deux adresses (fichier non chargés).
Merci beaucoup!