C'est un peu chaotique quand même ta façon de faire
Réécraser des fichiers comme ça, sans te soucier de la BDD.

J'espère pour toi qu'il n'y aura pas plus de problème que ça

Pour la réécriture, c'est pas une extension.
C'est des options à activer dans le menu site -> configuration de Joomla.