Ben les frames, c'est plusieurs pages justement... donc c'est normal qu'il sauve ton frameset en plusieurs pages, c'est justement le principe des frames 

Oui, éviter les frames c'est une bonne idée, ou remplacer ce qui s'y trouve par des fichiers inclus en javascript ou php ... sinon rendez vous dans la section referencement 

Explications : si par exemple google tombe sur une de tes pages dans ta frame, il va la mettre dans sa base de donnée. La personne qui clique sur le lien peut alors tomber sur une seule page de ta frame, genre le menu ou plus souvent la page centrale.
Solutions pour contrer ça :
- un javascript sur chacune de tes pages qui va ouvrir ta page d'index si la page n'est pas dans la frame (forcer les frames)
- mettre sur chacune de tes pages un tag noindex ... mais à  ce moment là leur contenu ne sera pas référencé par le moteur

Donc, sans rien, c'est incompréhensible, avec le javascript la personne n'a pas ce qu'elle croyait trouver, avec le noindex la page ne répondra pas à ce qu'elle cherche dans le moteur.

Mieux vaut un aprem de copier/coller, ou à comprendre les fichiers inclus en javascript ou php, que plusieurs dizaines de jours à ratraper un référencement foiré.

Bon courage